随后的八国联军入侵北京,目前虽然没有史料证明八国联军曾进入圆明园劫掠,但那些清朝驻守北京西郊的败兵游勇和地痞流氓,却趁慈禧以及清廷撤出北京的混乱之机,进入圆明园景区大量砍伐古树盗卖,有的甚至烧成木炭拿到市场上去卖。与此同时,圆明园残余的家具、陈设等也被大量洗劫,那些幸存的园中建筑物也开始被陆续拆毁。
清王朝覆灭后,一些军阀、官僚、政客乘机对圆明园景区内的精美建筑石料巧取豪夺,民间也有人肆意取用圆明园的石料。据载,当时的军阀王怀庆曾把圆明园中的一些石料拉走,用于修建自己的达园。位于辽宁抚顺的张作霖陵墓也用了不少圆明园内的东西。在今天的北京大学西门内矗立着一对造型精美的华表,据说也是当年从圆明园私拆走的,等等,不胜枚举,不一而足。